Il affirme la supériorité de la conscience individuelle sur les croyances et les dogmes traditionnels (Églises et Écritures). Il est ainsi le fondateur d'un système idéaliste, mystique et panthéiste, qu'il appelle lui-même le « transcendantalisme ». Il a écrit : la Méthode de la nature et l'homme réformé (1844), la Conduite de la vie (1860).